Santoro Claudio


Responsabile dell'U.O.

Cognome e Nome

SANTORO CLAUDIO

Qualifica

PO

Dipartimento

SCIENZE DELLA SALUTE c/o CAAD

Settore scientifico disciplinare

BIO/13 Biologia Applicata

E-mail

claudio.santoro@uniupo.it

Telefono

0321660609

Personale strutturato

Cognome e Nome

CORAZZARI MARCO

Qualifica

PA

Dipartimento

SCIENZE DELLA SALUTE c/o CAAD

Ente di appartenenza

UNIVERSITA’ PIEMONTE ORIENTALE - UPO

Cognome e Nome

COTELLA DIEGO

Qualifica

PA

Dipartimento

SCIENZE DELLA SALUTE

Ente di appartenenza

UNIVERSITA’ PIEMONTE ORIENTALE - UPO

Cognome e Nome

ESPINOZA STEFANO

Qualifica

RTDB

Dipartimento

SCIENZE DELLA SALUTE

Ente di appartenenza

UNIVERSITA’ PIEMONTE ORIENTALE - UPO

Cognome e Nome

SOLURI MARIAFELICIA STEFANO

Qualifica

Technician

Dipartimento

SCIENZE DELLA SALUTE

Ente di appartenenza

UNIVERSITA’ PIEMONTE ORIENTALE - UPO

Personale non strutturato

Cognome e Nome

Librasi Carlotta

Qualifica

Ph.D student

Dipartimento

SCIENZE DELLA SALUTE

Ente di appartenenza

UNIVERSITA’ PIEMONTE ORIENTALE - UPO

Cognome e Nome

Saverio Valentina

Qualifica

Ph.D student

Dipartimento

SCIENZE DELLA SALUTE

Ente di appartenenza

UNIVERSITA’ PIEMONTE ORIENTALE - UPO

Linee di ricerca

1. Autoimmunomics - Sfruttando la potenza della tecnologia basata sul phage display abbiamo sviluppato una piattaforma che consente la scoperta e la caratterizzazione delle interazioni biomolecolari (proteina-proteina, proteina-DNA, ecc.). Abbiamo costruito ampie phage display libraries di cDNA di diversi tessuti e cellule umane e le abbiamo utilizzate per profilare il repertorio di autoanticorpi (autoimmunomi) nei sieri di pazienti con malattie autoimmuni (ad esempio: diabete di tipo 1, malattia celiaca). 2. SINEUP: - SINEUPs sono RNA non codificanti in grado di stimolare specificamente la traduzione proteica di un mRNA di interesse. L'attività di SINEUP dipende dalla combinazione di due elementi: una breve sequenza all'estremità 5' (Binding Domain) che si appaia con il mRNA target, e una sequenza SINE B2 invertita (Effector Domain), essenziale per l'up-regulation della sintesi proteica. Stiamo sviluppando molecole SINEUP per indirizzare una varietà di mRNA codificanti proteine di interesse biotecnologico o terapeutico.

Tecnologie in uso dall'UO

  1. 1.
    Phage display
  2. 2.
    Proteomica
  3. 3.
    Citometria di massa
  4. 4.
    Microscopia confocale e multifotonica
  5. 5.
    Single cell RNA-seq
  6. 6.
    NGS
  7. 7.
    FACS
  8. 8.
    3D bioprinting
  9. 9.
    Analisi in vivo – luminescenza e CT
  10. 10.
    Esosome purification & analysis

Strumentazione

Denominazione

Illumina MySeq, NextSeq 550, SeqStudio
BD FACSymphony™ A5 analyzer, BD FACSAria™ Fusion sorter
Helios (CyTOF System) and Hyperion
BD Rapsody
2 x Thermo Scientific Q Exactive Plus
Leica Thunder 3D Imager, Leica SP8, Leica MP

Struttura ove la strumentazione è allocata

CAAD
CAAD
CAAD
CAAD
CAAD
CAAD

Responsabile

Marta Mellai
Annalisa Chiocchetti
Elena Canciani
Davide Raineri
Marcello Manfredi
Marco Corazzari

Pubblicazioni

  1. 1.
    SINEUP non-coding RNA activity depends on specific N6-methyladenosine nucleotides. Pierattini B, D'Agostino S, Bon C, Peruzzo O, Alendar A, Codino A, Ros G, Persichetti F, Sanges R, Carninci P, Santoro C, Espinoza S, Valentini P, Pandolfini L, Gustincich S. Mol Ther Nucleic Acids. 2023 Apr 7;32:402-414. doi: 10.1016/j.omtn.2023.04.002. eCollection 2023 Jun 13.
  2. 2.
    Neuronal haemoglobin induces loss of dopaminergic neurons in mouse Substantia nigra, cognitive deficits and cleavage of endogenous α-synuclein. Santulli C, Bon C, De Cecco E, Codrich M, Narkiewicz J, Parisse P, Perissinotto F, Santoro C, Persichetti F, Legname G, Espinoza S, Gustincich S. Cell Death Dis. 2022 Dec 16;13(12):1048. doi: 10.1038/s41419-022-05489-y.
  3. 3.
    The Gut-Ex-Vivo System (GEVS) Is a Dynamic and Versatile Tool for the Study of DNBS-Induced IBD in BALB/C and C57BL/6 Mice, Highlighting the Protective Role of Probiotics. Monzani R, Gagliardi M, Clemente N, Saverio V, Pańczyszyn E, Santoro C, Yissachar N, Visciglia A, Pane M, Amoruso A, Corazzari M. Biology (Basel). 2022 Oct 27;11(11):1574. doi: 10.3390/biology11111574.
  4. 4.
    SINEUPs: a novel toolbox for RNA therapeutics. Espinoza S, Bon C, Valentini P, Pierattini B, Matey AT, Damiani D, Pulcrano S, Sanges R, Persichetti F, Takahashi H, Carninci P, Santoro C, Cotella D, Gustincich S. Essays Biochem. 2021 Oct 27;65(4):775-789. doi: 10.1042/EBC20200114.
  5. 5.
    Gut-Ex-Vivo system as a model to study gluten response in celiac disease. Gagliardi M, Clemente N, Monzani R, Fusaro L, Ferrari E, Saverio V, Grieco G, Pańczyszyn E, Carton F, Santoro C, Del Mare-Roumani S, Amidror S, Yissachar N, Boccafoschi F, Zucchelli S, Corazzari M. Cell Death Discov. 2021 Mar 12;7(1):45. doi: 10.1038/s41420-021-00430-2.
  6. 6.
    InteractomeSeq: a web server for the identification and profiling of domains and epitopes from phage display and next generation sequencing data. Puccio S, Grillo G, Consiglio A, Soluri MF, Sblattero D, Cotella D, Santoro C, Liuni S, Bellis G, Lugli E, Peano C, Licciulli F. Nucleic Acids Res. 2020 Jul 2;48(W1):W200-W207. doi: 10.1093/nar/gkaa363.
  7. 7.
    Aldo-keto reductases protect metastatic melanoma from ER stress-independent ferroptosis. Gagliardi M, Cotella D, Santoro C, Corà D, Barlev NA, Piacentini M, Corazzari M. Cell Death Dis. 2019 Nov 28;10(12):902. doi: 10.1038/s41419-019-2143-7.
  8. 8.
    SINEUP non-coding RNAs rescue defective frataxin expression and activity in a cellular model of Friedreich's Ataxia. Bon C, Luffarelli R, Russo R, Fortuni S, Pierattini B, Santulli C, Fimiani C, Persichetti F, Cotella D, Mallamaci A, Santoro C, Carninci P, Espinoza S, Testi R, Zucchelli S, Condò I, Gustincich S. Nucleic Acids Res. 2019 Nov 18;47(20):10728-10743. doi: 10.1093/nar/gkz798.
  9. 9.
    High-throughput assessment of the antibody profile in ovarian cancer ascitic fluids. Antony F, Deantonio C, Cotella D, Soluri MF, Tarasiuk O, Raspagliesi F, Adorni F, Piazza S, Ciani Y, Santoro C, Macor P, Mezzanzanica D, Sblattero D. Oncoimmunology. 2019 Jun 4;8(9):e1614856. doi: 10.1080/2162402X.2019.1614856. eCollection 2019.
  10. 10.
    Mapping the minimum domain of the fibronectin binding site on transglutaminase 2 (TG2) and its importance in mediating signaling, adhesion, and migration in TG2-expressing cells. Soluri MF, Boccafoschi F, Cotella D, Moro L, Forestieri G, Autiero I, Cavallo L, Oliva R, Griffin M, Wang Z, Santoro C, Sblattero D. FASEB J. 2019 Feb;33(2):2327-2342. doi: 10.1096/fj.201800054RRR. Epub 2018 Oct 4

Dottorati di ricerca

Componente UO

Santoro Claudio

Dottorato di ricerca

Scienze Mediche e Biotecnologiche

Coordinatore

Gariglio Marisa

Sede

Novara