Direzione e uffici C.I.B.

Direzione CIB:
Prof. Claudio Schneider
Email: claudio.schneider@Lncib.it

Segreteria CIB:
Prof. Roberto Gambari
Email: roberto.gambari@unife.it

SEGRETERIA ORGANIZZATIVA:
Elisabetta Lambertini
Tel: 0532/974451
Fax: 0532/974484
E-mail: lmblbt@unife.it

AMMINISTRAZIONE:
Vanessa Florit
Area di Ricerca
Padriciano, 99 - 34012 Trieste
Tel: 040/398979
Fax: 040/398990
E-mail: cib@lncib.it

Posta certificata C.I.B.:
cib@poste-certificate.it

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Pesole Graziano Stampa
RESPONSABILE DELLA U. O.

Cognome e Nome Pesole Graziano
Qualifica Professore Ordianrio
Dipartimento Bioscienze, Biotecnologie e Scienze Farmacologiche
Settore Scientifico Disciplinare BIO/11
E-mail Questo indirizzo e-mail è protetto dallo spam bot. Abilita Javascript per vederlo.

PERSONALE STRUTTURATO

Cognome e Nome Volpicella Maria Teresa
Qualifica Ricercatore
Dipartimento Bioscienze, Biotecnologie e Scienze Farmacologiche
Ente di appartenenza Università di Bari
Cognome e Nome D'Erchia Anna Maria
Qualifica Ricercatore
Dipartimento Bioscienze, Biotecnologie e Scienze Farmacologiche
Ente di appartenenza Università di Bari
Cognome e Nome
Picardi Ernesto
Qualifica
Ricercatore
Dipartimento
Bioscienze, Biotecnologie e Scienze Farmacologiche
Ente di appartenenza
Università di Bari
Cognome e Nome Pepe Gabriella
Qualifica Professore Associato
Dipartimento Bioscienze, Biotecnologie e Scienze Farmacologiche
Ente di appartenenza Università di Bari
Cognome e Nome Chimienti Valentina
Qualifica Ricercatore
Dipartimento Bioscienze, Biotecnologie e Scienze Farmacologiche
Ente di appartenenza Università di Bari
Cognome e Nome De Giorgi Carla
Qualifica Professore Associato
Dipartimento Bioscienze, Biotecnologie e Scienze Farmacologiche
Ente di appartenenza Università di Bari

PERSONALE NON STRUTTURATO

Cognome e Nome Leoni Claudia
Qualifica Borsista
Dipartimento Bioscienze, Biotecnologie e Scienze Farmacologiche
Ente di appartenenza Università di Bari
Cognome e Nome Costanza Alessandra
Qualifica Dottoranda
Dipartimento Bioscienze, Biotecnologie e Scienze Farmacologiche
Ente di appartenenza Università di Bari
Cognome e Nome Fanizza Immacolata
Qualifica Dottoranda
Dipartimento Bioscienze, Biotecnologie e Scienze Farmacologiche
Ente di appartenenza Università di Bari
Cognome e Nome Manzari Cateria
Qualifica Assegnista
Dipartimento Bioscienze, Biotecnologie e Scienze Farmacologiche
Ente di appartenenza Università di Bari
Cognome e Nome MastroPasqua Francesca
Qualifica Dottoranda
Dipartimento Bioscienze, Biotecnologie e Scienze Farmacologiche
Ente di appartenenza Università di Bari
Cognome e Nome D'Antonio Mattia
Qualifica Dottorando
Dipartimento Bioscienze, Biotecnologie e Scienze Farmacologiche
Ente di appartenenza Università di Bari
Cognome e Nome Fosso Bruno
Qualifica Dottorando
Dipartimento Bioscienze, Biotecnologie e Scienze Farmacologiche
Ente di appartenenza Università di Bari
Cognome e Nome Valletti Alessio
Qualifica Assegnista
Dipartimento IBBE
Ente di appartenenza CNR

LINEE DI RICERCA

Since several years, studies have been carried out in order to understand the presence and the molecular function of parasitism gene/genes in plant parasitic nematodes. As a  matter of fact, the most widely means of controlling agricultural pests is the use of chemical products. Therefore only the development of a biotechnology  based system could possibly reduce or abolish toxic chemicals products. Our studies have indicated the chitin synthase gene is a very good candidate.  Moreover we have clearly indicated that the RNAi is a suitable and effective method to silencing the expression of this specific nematode gene.

A very important free living nematode is the Caenorhabditis elegans one of the best model organisms in biological research. It is easy to maintain in the laboratory, and it is  endowed  with many of the basic systems common to higher animals. In recent years, therefore we have used C.elegans as a model to understand the gene expression regulation in presence of toxic environment. The different effects of polycyclic aromatic hydrocarbons from air particulate were tested on the expression of several genes of crucial importance for the life cycle and the reproduction of the nematode. The overall results obtained seem to  confirm the previously reported ones showing that the toxicity is sustained by the lack of an efficient transcription machinery which is unable to produce proteins involved in DNA-repairing mechanisms.

The most recent studies tend to understand the regulation of eukaryotic gene expression by silencing  the homologue gene in C.elegans. In particular, the silencing of FAD  synthase gene has been achieved in C.elegans by RNAi. FAD synthase is a ubiquitous enzyme  involved in the FAD biosynthesis. Reducing by 50% the transcript level of FAD synthase by RNAi on the corresponding nematode gene, resulted in  very dramatic changes of the behavior in knock-down nematodes. These results are possibly due to altered cholinergic transmission, and indicate  C.elegans as an animal model system for studying human pathologies with altered flavin homeostasis

Finally, in collaboration with researcher of the Veterinary school of the University of  Bari, we have been involved in the comparative gene expression of vitellogenin and vitellogenin receptor  in wild  and in captive reared Atlantic Bluefin tuna. ( European Union funded research grant SELFDOTT)


TECNOLOGIE IN POSSESSO DELL'U. O.

  • Clonaggio
  • espressione ed analisi di proteine
  • Genome walking
  • Real Time PCR
  • Phage display
  • Analisi Bioinformatica
  • Genomica comparata ed evoluzione molecolare
  • RNAi in C. elegans

STRUMENTAZIONE

Denominazione
Struttura ove la strumentazione è allocata
Responsabile della strumentazione
Lettore Elisa
ex Dipartimento di Biochimica e Biologia Molecolare
Prof. Cantatore
Chemidoc gel System Biorad ex Dipartimento di Biochimica e Biologia Molecolare Prof. Cantatore
Strumentazione per elettroforesi bidimensionale ex Dipartimento di Biochimica e Biologia Molecolare Prof. Cantatore
Strumentazione per colture batteriche, lieviti ed eucariotiche ex Dipartimento di Biochimica e Biologia Molecolare Prof. Cantatore
MISEQ IBBE-CNR Prof. Pesole
Microscopio confocale IBBE-CNR Prof. Pesole

PUBBLICAZIONI

  1. Veronico Pasqua,  Lindsey J. Gray, John T. Jones, Paolo Bazzicalupo, Salvatore Arbucci, Maria Rosaria Cortese, Mauro Di Vito and Carla De Giorgi.(2001)  Nematode Chitin Synthases: Gene structure, expression and function in Caenorhabditis elegans and a plant parasitic nematode Meloidogyne artiellia. Mol Gen. Genomics 206,28-31.
  2. Veronico Pasqua, John Jones,  Mauro Di Vito   and Carla De Giorgi (2001) Horizontal transfer of a bacterial gene involved in polyglutamate biosynthesis to the plant-parasitic nematode Meloidogyne artiellia FEBS Letters 508, 470-474.
  3. De Giorgi C., Veronico P.,  De Luca F., Natilla A., Lanave C. and   Pesole G., (2002) Structural and evolutionary analysis of the ribosomal genes of the parasitic nematode Meloidogyne artiellia suggests its ancient origin Molecular and Biochemical Parasitology 124, 91-94.
  4. Fanelli E.,  Di Vito M., Cortese M.R. and De Giorgi C. (2002) Chitin synthase as molecular target in the plant parasitic nematode Meloidogyne artiellia. Nematology 4, 230-231.
  5. Veronico P., De Luca F.  and De Giorgi C. (2004). Molecular dissection of the rDNA array and of the 5S rDNA gene in Meloidogyne artiellia: phylogenetic and diagnostic implications. Molecular and Cellular Probes 18, 177-183.
  6. Fanelli, E., Di Vito, M., Jones, J. T. & De Giorgi, C. (2005) Analysis of chitin synthase function in a plant parasitic nematode, Meloidogyne artiellia, using RNAi, Gene. 349, 87-95.
  7. Pousis C., De Giorgi C., Mylonas C.C., Bridges C.R., Zupa R., Vassallo-Agius R., de la Gandara F., Dileo C., De Metrio G., Corriero A.( 2011) Comparative study of liver vitellogenin gene expression and oocyte yolk accumulation in wild and captive atlantic bluefin tuna (Thunnus thynnus L)  Animal Reproduction Science. 123, 98-105.
  8. Liuzzi Vania C., Daresta Barbara E., de Gennaro G., De Giorgi C. (2010) Different effects of polycyclic aromatic hydrocarbons in artificial and in environmental mixture on the free living nematode C.elegans. Journal of Applied Toxicology 32, 45-50. doi: 10.1002/jat.1634
  9. Liuzzi Vania C., Giancaspero Teresa A., Gianazza Elisabetta, Banfi Cristina, Barile Maria and  Carla De Giorgi (2012) Silencing of FAD synthase gene in Caenorhabditis elegans upsets protein homeostasis and impacts on complex behavioral patterns. Biochimica et Biophysica Acta 1820, 521-531
  10. Pousis C, Santamaria N, Zupa R, De Giorgi C, Mylonas CC, Bridges CR, de la Gándara F, Vassallo-Agius R, Bello G, Corriero A.(2012) Expression of vitellogenin receptor gene in the ovary of wild and captive Atlantic bluefin tuna (Thunnus thynnus). Anim. Reprod. Sci. 132, 101-10.


DOTTORATI DI RICERCA

Componente U.O. Dottorato di Ricerca Coordinatore Sede
Pesole Graziano
Biochimica, Biologia Molecolare e Bioinformatica
Cantatore Palmiro
Bari
Volpicella MariaTeresa Biochimica, Biologia Molecolare e Bioinformatica Cantatore Palmiro Bari
D'Erchia Anna Maria Biochimica, Biologia Molecolare e Bioinformatica Cantatore Palmiro Bari
Picardi Ernesto Biochimica, Biologia Molecolare e Bioinformatica Cantatore Palmiro Bari
Chimienti Guglielmina Biochimica, Biologia Molecolare e Bioinformatica Cantatore Palmiro Bari
De Giorgi Carla Biochimica, Biologia Molecolare e Bioinformatica Cantatore Palmiro Bari

CONGRESSI C.I.B.

Congressi Partecipazione
CNB7
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CNB10 SI
CNB11 SI