Direzione e uffici C.I.B.

Direzione CIB:
Prof. Claudio Schneider
Email: claudio.schneider@Lncib.it

Segreteria CIB:
Prof. Roberto Gambari
Email: roberto.gambari@unife.it

SEGRETERIA ORGANIZZATIVA:
Elisabetta Lambertini
Tel: 0532/974451
Fax: 0532/974484
E-mail: lmblbt@unife.it

AMMINISTRAZIONE:
Vanessa Florit
Area di Ricerca
Padriciano, 99 - 34012 Trieste
Tel: 040/398979
Fax: 040/398990
E-mail: cib@lncib.it

Posta certificata C.I.B.:
cib@poste-certificate.it

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Savino Maria Stampa
RESPONSABILE DELLA U. O.

Cognome e Nome Savino Maria
Qualifica
PROFESSORE ORDINARIO DI CHIMICA FISICA
Facoltà
SCIENZE MATEMATICHE FISICHE E NATURALI
Dipartimento
GENETICA E BIOLOGIA MOLECOLARE
Settore Scientifico Disciplinare C02
E-mail Questo indirizzo e-mail è protetto dallo spam bot. Abilita Javascript per vederlo.

PERSONALE STRUTTURATO

Cognome e Nome BIANCO ARMANDODORIANO
Qualifica PO
Dipartimento
Chimica
Ente di appartenenza
Università degli Studi di Roma
Cognome e Nome
CACCHIONE STEFANO
Qualifica RU
Dipartimento Genetica e Biologia Molecolare
Ente di appartenenza
Università degli Studi di Roma
Cognome e Nome CANEVA ROBERTO
Qualifica
Ricercatore
Dipartimento
Istituto di Biologia e Patologia Molecolari
Ente di appartenenza CNR
Cognome e Nome ORTAGGI GIANCARLO
Qualifica PO
Dipartimento
Chimica
Ente di appartenenza
Università degli Studi di Roma
Cognome e Nome SAVINO MARIA
Qualifica
PO
Dipartimento Genetica e Biologia Molecolare
Ente di appartenenza
Università degli Studi di Roma "La Sapienza"
Cognome e Nome
Qualifica
Dipartimento
Ente di appartenenza

PERSONALE NON STRUTTURATO

Cognome e Nome ALVINO ANTONELLO
Qualifica
Dottorando
Dipartimento Chimica
Ente di appartenenza Università degli Studi di Roma
Cognome e Nome
FRANCESCHIN MARCO
Qualifica
Assegnista di Ricerca
Dipartimento Chimica
Ente di appartenenza Università degli Studi di Roma
Cognome e Nome GALATI ALESSANDRA
Qualifica Borsista
Dipartimento Genetica e Biologia Molecolare
Ente di appartenenza Università degli Studi di Roma
Cognome e Nome MAURIELLO CLEMENTINA
Qualifica Dottorando
Dipartimento Genetica e Biologia Molecolare
Ente di appartenenza Università degli Studi di Roma
Cognome e Nome PASCUCCI EMANUELA
Qualifica Borsista
Dipartimento Genetica e Biologia Molecolare
Ente di appartenenza Università degli Studi di Roma
Cognome e Nome PISANO SABRINA
Qualifica
Dottorando
Dipartimento Genetica e Biologia Molecolare
Ente di appartenenza Università degli Studi di Roma

LINEE DI RICERCA

Organization of telomeric chromatin

The organization of telomeres, the nucleoproteic structures that protect the ends of eukaryotic chromosomes, has not yet fully described. In fact, telomeres are dynamic structures that change their organization and their function along with the cell cycle and cell differentiation. Nothwithstanding most of human telomeric sequences are organized in nucleosomes, the role of histone octamer in establishing the teloneric structure is still largely unknown. We are addressing several questions: 1) Peculiar structural features of telomeric nucleosomes (thermodynamic stability, positioning, intrinsic mobility of telomeric nucleosomes). 2) Ability of the telomeric proteins TRF1 and TRF2 to recognize their binding sites on the nucleosome forming specific ternary complexes. 3) Orgasnization of telomeric polynucleosomal arrays. 4) Organization of human telomeric chromatin in vivo.

Telomerase inhibitors as potential anticancer drugs

Telomeric sequences are synthesized by telomerase, a ribonucleoproteic enzyme which adds TTAGGG repeats at the 3’ single-stranded ends. In somatic cells telomerase is not active. Consequently, telomeres shorten at every replicative cycle till cells stop dividing. In tumor cells telomerase is reactivated, contributing to their uncontrolled proliferation. Thus, telomerase is considered a target for an anticancer strategy. We are studying a family of molecules that induce the formation and|or stabilization of a structure named G-quadruplex on the very single-stranded end of the telomere, in order to prevent the access of telomerase. Our starting point is PIPER, a perylene derivative that stabilize G-quadruplexes by stacking interactions with the terminal G tetrade. We are synthesizing perylene derivatives modifying lateral chains, in order to obtain more stable and efficient telomerase inhibitors.

TECNOLOGIE IN POSSESSO DELL'U. O.

  • PCR RT-PCR
  • Gel electrophoresis (mono e bidimensional)
  • Footprinting of DNA-protein complexes
  • Absorption spectroscopy of ligand-DNA complezes
  • Mass Spectrometry
  • Saggi di attività enzimatica
  • Basic techniques of genetic engineering
  • Visualization of FNA and complexes DNA-proteins at Atomic Force Microscopy
  • Molecular modeling applied to drug-design
  • Nuclear Magnetic Resonance (NMR)

STRUMENTAZIONE

Denominazione
Struttura ove la strumentazione è allocata
Responsabile della strumentazione
AFM Digital Nanoscope 3A
Dipartimento di Genetica e Biologia Molecolare
G. Micheli
Real-time PCR
Dipartimento di Genetica e Biologia Molecolare

Stanza per colture cellulari
Dipartimento di Genetica e Biologia Molecolare
M. Marchioni
Spettrometro di massa
Dipartimento di Chimica
Doddi
DICROGRAFO Jasco J 715 con sistema di termoregolazione
Dipartimento di Chimica
A. Scipioni
Instant Imager Packard
Dipartimento di Genetica e Biologia Molecolare

Spettrometro NMR Varian-Mercury 300 Mhz
Dipartimento di Chimica

PUBBLICAZIONI

1. L.ROSSETTI, M. FRANCESCHIN, S. SCHIRRIPA, A. BIANCO, G. ORTAGGI, SAVINO M. (2005). Selective interactions of perylene derivatives having different side chains with inter- and intramolecular G-quadruplex DNA structures. A correlation with telomerase inhibition. BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS. vol. 15 pp. 413-420 ISSN: 0960-894X
2. R. MECHELLI, C. ANSELMI, S. CACCHIONE, P. DE SANTIS, SAVINO M. (2004). Organization of telomeric nucleosomes: atomic force microscopy imaging and theoretical modeling. FEBS LETTERS. vol. 566 pp. 131-135 ISSN: 0014-5793
3. N. BESKER, C. ANSELMI, R. PAPARCONE, A. SCIPIONI, SAVINO M., P. DE SANTIS. (2003). Systematic search for compact structures of telomeric nucleosomes. FEBS LETTERS. vol. 554 pp. 369-372 ISSN: 0014-5793
4. S. CACCHIONE, J. L. RODRIGUEZ, R. MECHELLI, L. FRANCO, SAVINO M. (2003). Acetylated nucleosome assembly on telomeric DNA. BIOPHYSICAL CHEMISTRY. vol. 104 pp. 381-392 ISSN: 0301-4622
5. CANZONETTA C., CANEVA R., SAVINO M., SCIPIONI A., CATALANOTTI B., GALEONE A. (2002). CIRCULAR DICHROISM AND THERMAL MELTING DIFFERENTIATION OF HOECHST 33258 BINDING TO THE CURVED (A4T4) AND STRAIGHT (T4A4) DNA SEQUENCES. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA. vol. 1576 pp. 136-42 ISSN: 0006-3002
6. MATTEI S., SAMPAOLESE B., DE SANTIS P., SAVINO M. (2002). NUCLEOSOME ORGANIZATION ON KLUYVEROMYCES LACTIS CENTROMERIC DNAs. BIOPHYSICAL CHEMISTRY. vol. 97 pp. 173-187 ISSN: 0301-4622
7. ROSSETTI L, FRANCESCHIN M, BIANCO A, ORTAGGI G, SAVINO M. (2002). Perylene diimides with different side chains are selective in inducing different G-quadruplex DNA structures and in inhibiting telomerase. BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS. vol. 12 pp. 2527-2533 ISSN: 0960-894X
8. SAMPAOLESE B, BERGIA A, SCIPIONI A, ZUCCHERI G, SAVINO M., SAMORI' B, DE SANTIS P (2002). Recognition of the DNA sequence by an inorganic crystal surface. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA. vol. 99 pp. 13566-13570 ISSN: 0027-8424
9. ROSSETTI L., CACCHIONE S., DE MENNA A., CHAPMAN L., RHODES D., SAVINO M. (2001). Specific interactions of the telomeric protein Rap1p with nucleosomal binding sites. JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY. vol. 306 pp. 903-913 ISSN: 0022-2836
10. ANSELMI C., BOCCHINFUSO G., DE SANTIS P., SAVINO M., SCIPIONI A. (2000). THEORETICAL MODEL FOR THE PREDICTION OF SEQUENCE-DEPENDENT NUCLEOSOME THERMODYNAMIC STABILITY. BIOPHYSICAL JOURNAL. vol. 76 pp. 601-613 ISSN: 0006-3495

DOTTORATI DI RICERCA

Componente U.O. Dottorato di Ricerca Coordinatore Sede
SAVINO MARIA
Genetica e Biologia Molecolare
Prof. Irene Bozzoni
Università degli Studi di Roma "La Sapienza"

CONGRESSI C.I.B.

Congressi Partecipazione
CNB4

CNB5

CNB6

CNB7

CNB8

CNB9
CNB10