Direzione e uffici C.I.B.

Direzione CIB:
Prof. Claudio Schneider
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Segreteria CIB:
Prof. Roberto Gambari
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AMMINISTRAZIONE:
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Area di Ricerca
Padriciano, 99 - 34012 Trieste
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Posta certificata C.I.B.:
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Di Donato Alberto Stampa
RESPONSABILE DELLA U. O.

Cognome e Nome
Di Donato Alberto
Qualifica Professore Ordinario
Facoltà Scienze MFN
Dipartimento Biologia Strutturale e Funzionale
Settore Scientifico Disciplinare BIO10
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PERSONALE STRUTTURATO

Cognome e Nome Piccoli Renata
Qualifica
Professore Ordinario
Dipartimento Biologia Strutturale e Funzionale
Ente di appartenenza Univ. di Napoli Federico II
Cognome e Nome Arciello Angela
Qualifica
Ricercatore Confermato
Dipartimento Biologia Strutturale e Funzionale
Ente di appartenenza Univ. d Napoli Federico II
Cognome e Nome
Monti Daria Maria
Qualifica Ricercatore Confermato
Dipartimento Biologia Strutturale e Funzionale
Ente di appartenenza Univ. di Napoli Federico II
Cognome e Nome
Notomista Eugenio
Qualifica Ricercatore Confermato
Dipartimento Biologia Strutturale e Funzionale
Ente di appartenenza Univ. di Napoli Federico II
Cognome e Nome Pizzo Elio
Qualifica
Ricercatore Confermato
Dipartimento Biologia Strutturale e Funzionale
Ente di appartenenza Univ. di Napoli Federico II
Cognome e Nome
Cubellis Maria Vittoria
Qualifica Professore Associato
Dipartimento Biologia Strutturale e Funzionale
Ente di appartenenza Univ. di Napoli Federico II
Cognome e Nome Cafaro Valeria
Qualifica
Ricercatore Confermato
Dipartimento Biologia Strutturale e Funzionale
Ente di appartenenza Univ. di Napoli Federico II
Cognome e Nome Izzo Viviana
Qualifica
Ricercatore Confermato
Dipartimento Biologia Strutturale e Funzionale
Ente di appartenenza Univ. di Napoli Federico II
Cognome e Nome Scognamiglio Roberta
Qualifica Tecnico Laureato
Dipartimento Biologia Strutturale e Funzionale
Ente di appartenenza Univ. di Napoli Federico II
Cognome e Nome Bracale Aurora
Qualifica
Tecnico Laureato
Dipartimento Biologia Strutturale e Funzionale
Ente di appartenenza Univ. di Napoli Federico II
Cognome e Nome
Qualifica
Dipartimento
Ente di appartenenza
Cognome e Nome
Qualifica
Dipartimento
Ente di appartenenza

PERSONALE NON STRUTTURATO

Cognome e Nome De Giudice Rita
Qualifica Dottoranda
Dipartimento Biologia Strutturale e Funzionale
Ente di appartenenza
Univ. di Napoli Federico II
Cognome e Nome Fedele Carmine
Qualifica
Dottorando
Dipartimento Biologia Strutturale e Funzionale
Ente di appartenenza
Univ. di Napoli Federico II
Cognome e Nome
Qualifica
Dipartimento
Ente di appartenenza
Cognome e Nome
Qualifica
Dipartimento
Ente di appartenenza
Cognome e Nome
Qualifica
Dipartimento
Ente di appartenenza
Cognome e Nome
Qualifica
Dipartimento
Ente di appartenenza
Cognome e Nome
Qualifica
Dipartimento
Ente di appartenenza

LINEE DI RICERCA

Human Antitumor Immunoagents (C. De Lorenzo)
Amyloidosis and molecular mechanism of fibrillogenesis (R. Piccoli, A. Arciello, D. Monti)
Microorganisms and enzymes for biotransformations (A.Di Donato)
Fish RNases and Angiogenins (E. Pizzo)

TECNOLOGIE IN POSSESSO DELL'U. O.

  • Structural and functional characterization of native and recombinant proteins
  • Real time PCR
  • Immunochemical analyses
  • Protein Engineering
  • RNA Silencing
  • Cytofluorimetry

STRUMENTAZIONE

Denominazione
Struttura ove la strumentazione è allocata
Responsabile della strumentazione
FACS
Dipartimento di Biologia Strutturale e Funzionale Univ. Di Napoli Federico II
C. De Lorenzo
Sistema integrato per analisi di cellule in piastra
Dipartimento di Biologia Strutturale e Funzionale Univ. Di Napoli Federico II
C. De Lorenzo
Fermentatore
Dipartimento di Biologia Strutturale e Funzionale Univ. Di Napoli Federico II
A. Arciello
AKTA Purifier
Dipartimento di Biologia Strutturale e Funzionale Univ. Di Napoli Federico II
E. Pizzo
Phosphorimager
Dipartimento di Biologia Strutturale e Funzionale Univ. Di Napoli Federico II
D. Monti
Centrifuga per grossi volumi
Dipartimento di Biologia Strutturale e Funzionale Univ. Di Napoli Federico II
V. Izzo
LC/MS HPLC accoppiato a ZQ
Dipartimento di Biologia Strutturale e Funzionale Univ. Di Napoli Federico II
E. Notomista
BIACORE
Dipartimento di Biologia Strutturale e Funzionale Univ. Di Napoli Federico II
V. Cafaro

PUBBLICAZIONI

Borriello, M., Laccetti, P., Terrazzano, G., D’Alessio, G.,  De Lorenzo, C. A novel fully human antitumor ImmunoRNase targeting ErbB2-positive tumors. Br J Cancer (2011), in press.

Troise,  F.,  Monti, M., Merlino, A. , Cozzolino, F., Fedele, C., Russo Krauss, I., Sica, F., Pucci, P., D’Alessio, G., De Lorenzo, C. A novel ErbB2 epitope targeted by human antitumor immunoagents. FEBS Journal (2011), 278, 1156-1166.

Raimondi S.; Guglielmi F., Giorgetti S., Di Gaetano S., Arciello A., Monti D.M., Relini A., Nichino D., Doglia S.M., Natalello A., Pucci P., Mangione P., Obici L., Merlini G., Stoppini M., Robustelli P., Tartaglia G.G., Vendruscolo M., Dobson C.M., Piccoli R., Bellotti V. Effects of the known pathogenic mutations on the aggregation pathway of the amyloidogenic peptide of Apolipoprotein A-I. J. Mol. Biol. (2011) Feb 3 [Epub ahead of print] PMID: 21296086

Notomista, E., Pennacchio, F., Cafaro, V., Smaldone, G., Izzo, V., Troncone, L., Varcamonti, M. & Di Donato, A. The marine isolate Novosphingobium sp. PP1Y shows specific adaptation to use the aromatic fraction of fuels as the sole carbon and energy source Microb. Ecol. (2011) in press

Tinberg CE., Song WJ., Izzo V., Lippard SJ. Multiple Roles of Component Proteins in Bacterial Multicomponent Monooxygenases: Phenol Hydroxylase and Toluene/o-Xylene Monooxygenase from Pseudomonas sp. OX1. Biochemistry (2011) Mar 22;50(11):1788-98.

Chiaiese P., Minutolo M., Arciello A., Guglielmi F., Piccoli R., Filippone E.Expression of human apolipoprotein A-I in Nicotiana tabacum. Biotechnol. Lett. (2011) 33, 159-165. PMID: 20820879 [DOI 10.1007/s10529-010-0388-4].

Arciello A., De Marco N., Del Giudice R., Guglielmi F., Pucci P., Relini A., Monti D.M. and Piccoli R. Insights into the fate of the N-terminal amyloidogenic polypeptide of ApoA-I in cultured target cells. J. Cell. Mol. Med. (2011) Feb 9 doi: 10.1111/j.1582-4934.2011.01271.x. [Epub ahead of print] PMID: 21306558

Izzo, V., Leo, G., Scognamiglio, R., Troncone, L., Birolo, L. & Di Donato, A. PHK from phenol hydroxylase of Pseudomonas sp. OX1. Insight into the role of an accessory protein in Bacterial Multicomponent Monooxygenases Arch. Biochem. Biophys. (2011) 505, 48-59

Monti D.M., Guglielmi F., Monti M., Cozzolino F., Torrassa S., Relini A., Pucci P., Arciello A., Piccoli R. Effects of a lipid environment on the fibrillogenic pathway of the N-terminal polypeptide of human apolipoprotein A-I, responsible for in vivo amyloid fibril formation. Eur. Biophys J. (2010) 39, 1289–99.  PMID: 20182709.  DOI 10.1007/s00249-010-0582-2

Ruggiero A., Squeglia F., Izzo V., Silipo A., Vitagliano L., Molinaro A., Berisio R. Expression, Purification, Crystallization and Preliminary X-Ray Crystallographic Analysis of the Peptidoglycan Binding Region of the Ser/Thr Kinase PrkC from Staphylococcus aureus. Protein Pept Lett. (2010) 17, 1296-1299.

Esposito V., Guglielmi F., Martin S.R., Pauwels K., Pastore A., Piccoli R., Temussi P.A. Aggregation mechanisms of cystatins: a comparative study of monellin and orzacystatin. Biochemistry (2010) 49, 2805-10. DOI: 10.1021/bi902039s

Notomista, E., Cafaro, V., Bozza, G., & Di Donato, A. The Molecular Determinants of the Regioselectivity of Toluene, o-Xylene Monooxygenase from Pseudomonas sp. OX1. Appl. Environ. Microbiol. (2009) 75, 823-836

Zanfardino, A., Restaino, O.F., Notomista, E., Cimini, D., Schiraldi, C., De Rosa, M., De Felice, M., & Varcamonti, M. Isolation of an Escherichia coli K4 kfoC mutant over-producing capsular chondroitin. Microb Cell Fact. (2010) 79, 34.

Miele, A., Giardina, P., Notomista, E., Piscitelli, A., Sannia, G., & Faraco, V. A semi-rational approach to engineering laccase enzymes. Mol Biotechnol (2010) 46,149-56

Spadaccini, R., D'Errico, G., D'Alessio, V., Notomista, E., Bianchi, A., Merola, M., & Picone, D. Structural characterization of the transmembrane proximal region of the hepatitis C virus E1 glycoprotein. Biochim Biophys Acta.(2010) 1798, 344-53

Gelardi T., Damiano V., Rosa R., Bianco R., Cozzolino R., Tortora G., Laccetti P., D’Alessio G., De Lorenzo C. Two novel human anti-ErbB2 immunoagents are active on Trastuzumab-resistant tumors. Br J Cancer (2010), 102, 513-519.

Riccio G., Esposito G., Leoncini E., Contu R., Condorelli G., Chiariello M.,Laccetti P., Hrelia S., D'Alessio G., De Lorenzo C. Cardiotoxic effects, or lack thereof, oh human anti-ErbB2 immunoagents. FASEB J. (2009), 23, 3171-3178.

Tedesco A., D'Agostino D., Soriente I., Amato P., Piccoli R., Sabatini P.A new strategy for the early diagnosis of rheumatoid arthritis: A combined approach. Autoimmun Rev. (2009) 8, 233-237.

Guglielmi F., Monti D.M., Arciello A., Torrassa S., Cozzolino F., Pucci P., Relini A., Piccoli R. Enzymatically active fibrils generated by self-assembly of the ApoA-I fibrillogenic domain functionalized with a catalytic moiety. Biomaterials (2009) 30, 829-835.

Merlino A., Avella G., Di Gaetano S., Arciello A., Piccoli R., Mazzarella L. and Sica F. Structural features for the mechanism of antitumor action of a dimeric human pancreatic ribonuclease variant. Protein Sci. (2009)

Monti D.M., Yu W., Pizzo E., Shima K., Hu M.G., Di Malta C., Piccoli R., D'Alessio G., Hu G.F. Characterization of the angiogenic activity of zebrafish ribonucleases. FEBS J. (2009) 276, 4077-90.

De Lorenzo C. , D'Alessio G. Human anti-ErbB2 Immunoagents: immunoRNases and compact antibodies. FEBS J. (2009), 276, 1527–1535.

Riccio G, Borriello M, D'Alessio G, De Lorenzo C. A Novel Human Anti-tumor Dimeric ImmunoRNase. Journal of Immunotherapy (2008), 31, 440-5.

De Lorenzo C. , D'Alessio G. From Immunotoxins to ImmunoRNases. Current Pharmaceutical Biotechnology (2008), 9, 210-214.

Troise F, Cafaro V, Giancola C, D'Alessio G, & De Lorenzo C. Differential binding of human immunoagents and Herceptin to the ErbB2 receptor. FEBS J. (2008) 275(20):4967-79.

Leone, S., Lanzetta, R., Scognamiglio, R., Alfieri, F., Izzo, V., & Di Donato, A., Parrilli, M., Holst, O., & Molinaro, A.The structure of the O-specific polysaccharide from the lipopolysaccharide of Pseudomonas sp. OX1 cultivated in the presence of the azo dye Orange IICarbohydr Res. (2008) 343, 674-684

Newcomb M., Chandrasena RE., Lansakara-P DS., Kim HY., Lippard SJ., Beauvais LG., Murray LJ., Izzo V., Hollenberg PF., Coon MJ. Products from enzyme-catalyzed oxidations of norcarenes. J.Org.Chem. (2007) 72, 1128-33.

Newcomb M., Chandrasena RE., Lansakara-P DS., Kim HY.,  Lippard SJ., Beauvais LG., Murray LJ., Izzo V., Hollenberg PF., Coon MJ. Desaturase reactions complicate the use of norcarane as a mechanistic probe. Unraveling the mixture of twenty-plus products formed in enzyme-catalyzed oxidations of norcarane. J.Org.Chem.(2007) 72, 1121-1127.

De Lorenzo C., Troise F., Cafaro V., & D’Alessio G. Combinatorial experimental protocols for Erbicin-derived immunoagents and Herceptin. Br J Cancer. (2007), 97, 1354-1360.

De Lorenzo, C.,  Di Malta, C., Calì, G., Troise, F.,  Nitsch , L., D'Alessio, G. Intracellular route and mechanism of action of Erb-hRNase, a human anti-ErbB2 anticancer immunoagent. FEBS  Letters (2007), 581, 296-300.

Lodato, A., Alfieri, F., Olivieri, G., Di Donato, A., Marzocchella, A. & Salatino, P. Azo-dye conversion by means of Pseudomonas sp. OX1 Enzyme Microb Tech (2007) 41, 646-652

Viggiani, A., Olivieri, G., Siani, L., Di Donato, A., Marzocchella, A. & Salatino, P. An airlift bioreactor for the biodegradation of phenol by Pseudomonas stutzeri OX1 J. Biotech. (2006) 123, 464-477

Siani, L., Papa, R., Di Donato, A., & Sannia, G. Recombinant expression of Toluene o-Xylene Monooxygenase (ToMO) from Pseudomonas stutzeri OX1 in the marine Antarctic bacterium Pseudoalteromonas haloplanktis TAC125 J. Biotech. (2006) 126, 334-341

Siani, L., Viggiani, A., Notomista, E., Pezzella, A. & Di Donato, A. The role of residue Thr249 in modulating the catalytic efficiency and substrate specificity of catechol 2,3-dioxygenase from Pseudomonas stutzeri OX1 FEBS J. (2006) 273, 2963-2976

Notomista, E,, Mancheño, J.M., Crescenzi O., Di Donato A., Gavilanes J. & D’Alessio G. The role of electrostatic interactions in the antitumor activity of dimeric rnases FEBS J. (2006) 273, 3687-3697

Leone, S., Molinaro, A., Alfieri, F., Cafaro, V., Lanzetta, R., Di Donato, A., & Parrilli, M. The biofilm matrix of Pseudomonas sp. OX1 grown on phenol is mainly constituted by alginate oligosaccharides Carbohydr Res. (2006) 341, 2456-2461

Sazinsky, M. H., Dunten P. W., McCormick M. S., Di Donato, A. & Lippard, S. J. X-ray Structure of a Hydroxylase-Regulatory Protein Complex from a Hydrocarbon-Oxidizing Multicomponent Monoxygenase, Pseudomonas stutzeri OX1 Phenol Hydroxylase Biochemistry (2006) 45, 15392-15404

Di Gaetano S., Guglielmi F., Arciello A., Mangione P., Monti M., Pagnozzi D., Raimondi S., Giorgetti S., Orrù S., Canale C., Pucci P., Dobson C.M., Bellotti V., Piccoli R. (2006) Recombinant amyloidogenic domain of ApoA-I: Analysis of its fibrillogenic potential. Biochem. Biophys. Res. Commun. 351, 223-228.

De Lorenzo C, Cozzolino R, Carpentieri A, Pucci P, Laccetti P, D'Alessio G. (2005) Biological properties of a human compact anti-ErbB2 antibody. Carcinogenesis 26, 1890-1895.

Naddeo M, Vitagliano L, Russo A, Gotte G, D'Alessio G, Sorrentino S. (2005) Interactions of the cytotoxic RNase A dimers with the cytosolic ribonuclease inhibitor. FEBS Lett. 579, 2663

Merlino, A., Mazzarella, L., Di Fiore, A., Carannante, A., Notomista, E., Di Donato, A., F. Sica. Structural and dynamic studies on Onconase mutants ACTA CRYSTALLOGRAPHICA. SECTION A, FOUNDATIONS OF CRYSTALLOGRAPHY(2005) 61, C185-C186

Bucci E, Vitagliano L, Barone R, Sorrentino S, D'Alessio G, Graziano G. (2005) On the thermal stability of the two dimeric forms of ribonuclease A. Biophys Chem. 116, 89-95

Leone, S., Izzo, V., Lanzetta, R., Parrilli, M., Molinaro, A., & Di Donato, A. The structure of the O-polysaccharide from Pseudomonas stutzeri OX1 containing two different 4-acylamido-4,6-dideoxy-residues, tomosamine and perosamine. Carbohydr Res. (2005) 340, 651-6

Merlino, A., Mazzarella, L., Carannante, A., Di Fiore, A., Di Donato, A., Notomista, E., & Sica, F. The importance of dynamic effects on the enzyme activity: X-ray structure and molecular dynamics of onconase mutants. J. Biol. Chem. (2005) 280, 17953-17960

Cafaro, V., Notomista, E., Capasso, P., & Di Donato, A. The regiospecificity of two multicomponent monooxygenases from Pseudomonas stutzeri OX1: molecular basis for the catabolic adaptation of the microorganism to methylated aromatic compounds Appl. Environ. Microbiol. (2005) 71, 4736-4743

Cafaro, V., Notomista, E., Capasso, P., & Di Donato, A. Mutation of glutamic-103 of toluene o-xylene monoxygenase as a control of the catabolic efficiency of a recombinant upper pathway for the degradation of methylated aromatic compounds Appl. Environ. Microbiol. (2005) 71, 4744-4750

Izzo, V., Notomista, E., Picardi, A., Pennacchio, F.  & Di Donato, A. The thermophilic archaeon Sulfolobus solfataricus is able to grow on phenol Research in Microbiology (2005) 156, 677-689

Sazinsky, M.H., Bard, J., Di Donato, A. & Lippard, S.J. Structure of the Toluene/o-Xylene Monooxygenase Hydroxylase from Pseudomonas stutzeri OX1 J. Biol. Chem. (2004) 279, 30600-30610

Monti DM, D'Alessio G. (2004) Cytosolic RNase inhibitor only affects RNases with intrinsic cytotoxicity. J Biol Chem. 279, 39195-39198

De Lorenzo, C., Arciello, A., Cozzolino, R., Palmer, D. B., Laccetti, P., Piccoli, R., D'Alessio, G. (2004) A fully human antitumor immunoRNase selective for ErbB-2-positive carcinomas. Cancer Res. 64, 4870-4874

De Lorenzo, C., A. Tedesco, G. Terrazzano, R. Cozzolino, P. Laccetti, R. Piccoli and G. D’Alessio (2004) A human, compact, fully functional anti-ErB2 antibody as a novel amtitumour agent. Brit.J.Cancer. 91, 1200-1204.

Spalletti-Cernia, D. Sorrentino, R., Di Gaetano, S. Piccoli, R., Santoro, M., D'Alessio, G., Laccetti, P. and Vecchio, G. (2003) Highly selective toxic and pro-apoptotic effects of two dimeric ribonucleases on thyroid cancer cells compared to the effects of doxorubicin. British J. Cancer 88, 2900-2907

Notomista, E., Lahm, A, Di Donato, A. & Tramontano, A. Evolution of Bacterial Multicomponent Monooxygenases J. Mol. Evol. (2003) 56, 435-445


DOTTORATI DI RICERCA

Componente U.O. Dottorato di Ricerca Coordinatore Sede
Piccoli R.
Biotecnologie
Giovanni Sannia
Univ di Napoli Federico II
Di Donato A.
Biotecnologie
Giovanni Sannia
Univ di Napoli Federico II

CONGRESSI C.I.B.

Congressi Partecipazione
CNB4

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